NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ...
之前整理的一篇大综述 — Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这收到了热烈反响,阅读人数过万。 行文很长,最后精炼下来的文字近三万,适合深度阅读思考。 上次发出时,有读者留言说部分专业名词不理解。为了方便理解和对综述有个概览,特整理了 ...
尽管RNA-seq有许多优势,但许多研究者还是在继续使用芯片,尤其是样本量比较大的研究。芯片在临床研究中也很吃香,因为它的数据处理又快又简单。 DNA芯片(上图左侧)由附着在表面的核酸探针组成。首先,从样品中提取RNA并转化为互补DNA(cDNA),用荧光 ...
哈佛大学的两个团队将微流体技术引入单细胞RNA-Seq方法中,分别开发出Drop-seq和inDROP。2015年,这两种方法发表在同一期的《Cell》杂志上。它们的出现,让快速、低成本地分析数千个单细胞的基因活性成为现实。 众所周知,大脑是一种复杂的结构。它包括近860亿 ...