本研究利用生物信息学分析NCBI-GEO数据库的3个GSE数据集,筛选出1601个差异表达基因(DEGs),包括1103个上调和498个下调基因。通过Cytoscape、MCODE和CytoHubba鉴定出37个核心基因(Hub genes),其中ACTB、ALB等位列前十,ACTB为最显著节点(度值243)。这些基因为JEV治疗 ...
2 型糖尿病(T2DM)和冠状动脉疾病(CAD)是常见的共存临床疾病,在全球范围内的发病率仍在增长。最近,循环RNA(miRNA)已成为心脏代谢疾病中的新型分子参与者。本研究旨在确定特异性 miRNA 特征作为 T2DM 中 CAD 的候选生物标志物,并描绘导致糖尿病动脉粥样 ...
近日,成都东软学院与澳门初创智库协会携手打造的免费线上编程学习平台——Mcode公益项目上线发布会在澳门举行。由副校长张兵、计算机与软件学院副院长赵荷、云萌工作室指导教师袁睿及部分项目组成员组成的成都东软学院代表团出席发布会。 发布会现场 ...
9月26日,成都东软学院与澳门初创智库协会携手打造的免费线上编程学习平台——Mcode公益项目在澳门成功上线。 据了解,Mcode公益项目是成都东软学院的重要创新成果,是推动数字教育发展方面的重要举措。该项目坚持“数智赋能教育,创新服务社会”的宗旨 ...
toscape是出名的网络可视化神器,它支持的网络种类很多。比如蛋白互作(PPI)、转录调控网络图(TF-target)、网络聚类模块分析(Module)、miRNA调控靶标基因网络图、竞争性内源RNA网络(ceRNA)、通路交互网络(pathway-crosstalk)等。 Cytoscape的插件很多,选择哪个好呢 ...
生信分析中我们经常会做KEGG和GO富集分析,一般拿到结果后就想到用柱状图展示pathway的富集情况。比如下面这样: 如果学会使用Cytoscape中的ClueGO+CluePedia插件,可以帮我们更形象地展示pathway之间的关系,以及gene在pathway中的富集情况,论文插图瞬间提示一个档次 ...
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