西北工业大学计算机学院尚学群教授团队在单细胞与空间转录组数据整合分析方面取得新研究进展，研究成果以“stSCI：一种用于整合分析单细胞与空间转录组数据的多任务学习框架（stSCI: A multi-task learning framework for integrative analysis of single-cell and spatial ...

本研究针对空间转录组学数据中基因共表达网络推断时难以区分真实生物学相互作用与空间邻近效应的问题，开发了spMOCA（空间信息矩阵正态模型）。该方法通过联合建模基因-基因协方差和空间协方差，在九大数据集上验证显示其能更准确识别转录因子靶基因 ...

空间转录组学（Spatial Transcriptomics）是一种能够同时揭示基因表达和细胞空间分布的技术。它通过将细胞和组织样本进行切片，再使用高通量测序技术对切片上的mRNA进行测序，从而获得细胞在空间上的基因表达信息。空间代谢组学（Spatial Metabolomics）是一种通过 ...

来自剑桥大学的研究团队提出了一个名为 Celcomen 的虚拟组织模型，这是首个在空间转录组学分析中具有因果推断可识别性的模型，不仅能估计环境对单个细胞的影响，还能推测单个细胞对其周围环境及整体组织的影响。 在生物学领域，细胞的基因表达谱同时 ...

在细胞科学探究中，了解单个细胞随着时间推移如何生长、分化和变化，是揭示生命奥秘的关键。单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术使科学家能够详细分析单个细胞的基因表达情况，从而揭示细胞在不同状态下的动态变化。然而，由于测序过程会破坏细胞，导致无法 ...

本文第一作者为斯坦福大学研究生蔡闻骁，此前，他以绩点第一名的成绩在东南大学取得学士学位。他的研究兴趣为多模态大模型、具身智能。此工作为其在上海交通大学访问和北京智源人工智能研究院实习期间完成，导师为本文通讯作者赵波教授。 此前，李飞 ...

清华大学生命科学学院/结构生物学高精尖创新中心/清华-北大生命科学联合中心张强锋副教授课题组开发了基于图自编码器 ...

6月13日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈洛南研究组与东华大学左春满团队合作，在《自然-通讯》（Nature Communications）上，在线发表了题为Dissecting tumor microenvironment from spatially resolved transcriptomics data by heterogeneous graph ...

革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展 本文中，小编整理了多篇重要研究成果，共同解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新 ...

细胞在组织和器官内的空间位置，对其发挥特定功能颇为重要。近年来，快速发展的空间转录组（Spatial Transcriptomics）技术能够同时测量生物组织切片空间位点的基因表达和空间位置信息，为研究人员破译组织的空间结构，探讨周围环境对细胞基因表达的影响 ...